Raw Data ফাইলগুলি কী, এতে কী কী তথ্য থাকে এবং কীভাবে ব্যবহার করা হয়?

আপডেট করা হয়েছে

স্টার্টার এবং অ্যাডভান্সড কিটগুলিতে কাঁচা ডেটা

কাঁচা তথ্য ফাইল হলো সেই ফাইল যেখানে প্রক্রিয়াজাত না করা জেনেটিক তথ্য থাকে; অর্থাৎ, লালা নমুনা থেকে সরাসরি পরীক্ষাগারে উৎপাদিত কাঁচা তথ্য । এই ফাইলগুলিতে আপনার ডিএনএ অধ্যয়নের জন্য ব্যবহৃত জিনোটাইপিং অ্যারেতে উপস্থিত সমস্ত জেনেটিক মার্কার থাকে, যার মধ্যে আপনার জিনোটাইপ (আপনার কাছে থাকা নিউক্লিওটাইড এবং জিনোমে তাদের অবস্থান) সম্পর্কে তথ্য অন্তর্ভুক্ত থাকে।

যদিও কোন ভেরিয়েন্টগুলি বিশ্লেষণের জন্য উপযুক্ত তা নির্ধারণের জন্য এই ফাইলগুলির মান নিয়ন্ত্রণ করা হয়নি, টেলমিজেন ব্যবহারকারীরা তাদের নিজস্ব র ডেটা ফাইল অ্যাক্সেস করতে পারেন, যা তাদের ব্যক্তিগত অ্যাকাউন্ট থেকে .csv ফর্ম্যাটে ডাউনলোডের জন্য উপলব্ধ। এই ফাইলটিতে প্রতিটির জন্য জেনেটিক মার্কার এবং সংশ্লিষ্ট জিনোটাইপ রয়েছে।

এছাড়াও, যদি আপনার কাছে 23andMe , Ancestry, অথবা MyHeritage এর মতো অন্যান্য বিশেষায়িত কোম্পানির Raw Data ফাইল থাকে, তাহলে আপনি আমাদের অফার করা বিশ্লেষণগুলি অ্যাক্সেস করার জন্য সেগুলি tellmeGen- এ আপলোড করতে পারেন।

কাঁচা ডেটা ফাইলে নিম্নলিখিত বিবরণ থাকে:

  • rsid : পাবলিক ডাটাবেস dbSNP- তে একটি মানবিক পরিবর্তন সংজ্ঞায়িত করে এমন সংখ্যা।
  • ক্রোমোজোম : ক্রোমোজোম সংখ্যা যেখানে জেনেটিক বৈকল্পিকটি অবস্থিত, যার মধ্যে রয়েছে যৌন ক্রোমোজোম (X, Y) এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল ক্রোমোজোম (MT)।
  • অবস্থান : GRCh37 ডাটাবেস অনুসারে জেনেটিক মার্কারটির অবস্থান।
  • জিনোটাইপ : জেনেটিক মার্কারগুলির জিনোটাইপের ফলাফল, যা নিউক্লিওটাইডের সংমিশ্রণ (A, T, G, C) দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয় অথবা সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলার জন্য যথাক্রমে I এবং D অক্ষর দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়।

আপনার tellmeGen অ্যাকাউন্ট থেকে সেটিংসকিটসডাউনলোড র ডেটা বিভাগে, র ডেটা .zip ফর্ম্যাটে ডাউনলোড করা হয়।

এটা মনে রাখা গুরুত্বপূর্ণ যে এই তথ্য শুধুমাত্র তথ্যগত উদ্দেশ্যে এবং চিকিৎসা নির্ণয়ের জন্য ব্যবহার করা উচিত নয়। আপনি এই ফাইলগুলি অন্যান্য জেনেটিক বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মেও আপলোড করতে পারেন।

আল্ট্রা কিটে কাঁচা তথ্য

  • VCF ফাইল : লিঙ্কটিতে ক্লিক করে এই ফাইল সম্পর্কে তথ্য অ্যাক্সেস করুন।
  • FASTQ ফাইল : লিঙ্কটিতে ক্লিক করে এই ফাইল সম্পর্কে তথ্য অ্যাক্সেস করুন।