MyVariants এবং MyVariants Ultra ফাইলগুলো কী এবং সেগুলো কী কাজে ব্যবহার করা হয়?

আপডেট করা হয়েছে

MyVariants এবং MyVariants Ultra ফাইলগুলি CSV ফরম্যাটে রয়েছে, যা সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং (WGS) ডেটা থেকে তৈরি করা হয়েছে, যা আপনার 100% DNA বিশ্লেষণ করে। এই ফাইলগুলি ব্যবহারকারীর জেনেটিক তথ্যের একটি অংশকে আরও সহজ, সুসংগঠিত ফরম্যাটে এবং জেনোটাইপিং অ্যারে বিশ্লেষণে ব্যবহৃত কাঁচা ডেটা ফাইলের মতো করে অ্যাক্সেস করার সুবিধার জন্য তৈরি করা হয়েছে।

উভয় ফাইলগুলিতে ভেরিয়েন্ট আইডি (rsID), জিনোমিক পজিশন (GRCh37) এবং ব্যবহারকারীর জেনোটাইপ সহ কলামগুলিতে সংগঠিত জেনেটিক তথ্য রয়েছে। এর উদ্দেশ্য হলো FASTQ, CRAM, বা VCF-এর মতো জটিল প্রযুক্তিগত ফাইলগুলির সাথে সরাসরি কাজ না করেও তথ্য পরীক্ষা করার একটি আরও অ্যাক্সেসযোগ্য উপায় প্রদান করা।

MyVariants ফাইলটি মূলত আল্ট্রা ডিএনএ টেস্টের ব্যবহারকারীদের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে যারা তাদের জেনেটিক ডেটা অন্যান্য কাঁচা ডেটা ফাইল-সামঞ্জস্যপূর্ণ প্ল্যাটফর্মে ব্যবহার করতে চান। এর কাঠামো কিছু বাহ্যিক সরঞ্জামকে জেনোটাইপিং অ্যারে থেকে প্রাপ্ত ডেটার মতো একইভাবে জেনেটিক তথ্য সনাক্ত করতে এবং প্রক্রিয়া করতে সহায়তা করে।

অন্যদিকে, MyVariants Ultra ফাইলটিতে তথ্যের একটি বিস্তৃত সংস্করণ রয়েছে। MyVariants-এ অন্তর্ভুক্ত ডেটা ছাড়াও, এতে এমন ভেরিয়েন্টগুলির জেনোটাইপও অন্তর্ভুক্ত রয়েছে যেখানে ব্যবহারকারীর রেফারেন্স/রেফারেন্স জেনোটাইপ নেই। এটি ব্যবহারকারীর জিনোমের রেফারেন্স জিনোম থেকে পার্থক্যগুলির অবস্থানগুলি আরও বিস্তারিতভাবে অন্বেষণ করতে সহায়তা করে।

MyVariants ফাইলের বৈশিষ্ট্য:

  • সহজ ফরম্যাট: এটি CSV ফরম্যাটে সরবরাহ করা হয়, যা এক্সেল, গুগল শীট বা মৌলিক বায়োইনফরমেটিক্স সরঞ্জামগুলির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ।

  • অ্যারের কাঁচা ডেটার মতো কাঠামো: এটি জেনেটিক তথ্য এমন একটি ফরম্যাটে উপস্থাপন করে যা জেনোটাইপিং ফাইলগুলির সাথে কাজ করা ব্যবহারকারীদের কাছে পরিচিত।

  • বাহ্যিক প্ল্যাটফর্মগুলিতে ব্যবহার: এটি তৃতীয় পক্ষের প্ল্যাটফর্মগুলিতে ডেটা আপলোড করার সুবিধা দেয় যা সুসংগঠিত জেনেটিক ফাইল গ্রহণ করে।

  • অ্যাক্সেসযোগ্যতা: এটি জটিল প্রযুক্তিগত ফরম্যাটগুলির চেয়ে সহজ উপায়ে নির্দিষ্ট জেনোটাইপগুলি পরীক্ষা করার অনুমতি দেয়।

MyVariants Ultra ফাইলের বৈশিষ্ট্য:

  • আরও বিশদ স্তর: এতে WGS বিশ্লেষণ থেকে প্রাপ্ত ভেরিয়েন্টের আরও বিস্তৃত নির্বাচন অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।

  • নন-রেফারেন্স/রেফারেন্স ভেরিয়েন্ট: এতে এমন ভেরিয়েন্টগুলির জেনোটাইপ রয়েছে যেখানে ব্যবহারকারী রেফারেন্স জিনোমের থেকে পার্থক্য উপস্থাপন করে।

  • উন্নত কিন্তু অ্যাক্সেসযোগ্য অন্বেষণ: এটি এমন ব্যবহারকারীদের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে যারা তাদের জেনেটিক তথ্য আরও গভীরভাবে পর্যালোচনা করতে চান, তবে VCF, CRAM বা FASTQ ফাইলগুলি সরাসরি পরিচালনা করার প্রয়োজন ছাড়াই।

  • CSV ফরম্যাট: এটি নিয়মিত স্প্রেডশীট সরঞ্জামগুলির সাথে খোলা যেতে পারে, যা নির্দিষ্ট ভেরিয়েন্টগুলি অনুসন্ধান, ফিল্টারিং এবং পর্যালোচনা করা সহজ করে তোলে।

সীমাবদ্ধতা:

  • এটি একটি ব্যাখ্যামূলক রিপোর্টের সমতুল্য নয়: MyVariants এবং MyVariants Ultra ফাইলগুলিতে জেনেটিক ডেটা থাকে, তবে তারা নিজেরা কোনও চিকিৎসা, ক্লিনিকাল বা ডায়াগনস্টিক ব্যাখ্যা প্রদান করে না।

  • VCF-এর বিকল্প নয়: যদিও এই ফাইলগুলি ভেরিয়েন্টগুলি পরীক্ষা করা সহজ করে তোলে, VCF ফাইলটি জিনোমিক ভেরিয়েন্টগুলির বায়োইনফরমেটিক বিশ্লেষণের জন্য সবচেয়ে সম্পূর্ণ এবং মানসম্মত প্রযুক্তিগত ফরম্যাট হিসাবে রয়ে গেছে।

  • পরিবর্তনশীল সামঞ্জস্য: কিছু বাহ্যিক প্ল্যাটফর্ম সমস্ত ফরম্যাট গ্রহণ করতে পারে না বা ফাইলের নির্দিষ্ট অভিযোজন প্রয়োজন হতে পারে।

  • ব্যাখ্যায় সতর্কতা প্রয়োজন: একটি নির্দিষ্ট জেনোটাইপের উপস্থিতি অগত্যা একটি চিকিৎসা অবস্থা, প্রবণতা বা নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্য বোঝায় না। ব্যাখ্যা সর্বদা উপযুক্ত প্রেক্ষাপটে এবং স্বাস্থ্য-সম্পর্কিত তথ্যের ক্ষেত্রে, যোগ্যতাসম্পন্ন পেশাদারদের দ্বারা করা উচিত।

ফরম্যাট এবং ডাউনলোড:

যারা 30x WGS পরীক্ষা করেছেন, তাদের জন্য MyVariants এবং MyVariants Ultra ফাইলগুলি ছাড়াও, আমরা FASTQ, CRAM এবং VCF-এর মতো অন্যান্য ফরম্যাটও সরবরাহ করি। আপনি আপনার tellmeGen ব্যবহারকারী অ্যাকাউন্ট থেকে সরাসরি এই ফাইলগুলি ডাউনলোড করতে পারেন।