আল্ট্রা টেস্ট ডাউনলোড বিভাগে ফাইলগুলি উপলব্ধ

ULTRA টেস্টের ডাউনলোড বিভাগে আপনি আপনার সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং (WGS) ডেটা থেকে তৈরি বিভিন্ন ধরনের ফাইল পাবেন। এই ফাইলগুলি দুটি প্রধান বিভাগে সাজানো হয়েছে: "ডাউনলোড" এবং "প্রযুক্তিগত ডাউনলোড"। 

প্রথমত, “ডাউনলোড” বিভাগে CSV ফরম্যাটের দুটি ফাইল অন্তর্ভুক্ত রয়েছে, যা ব্যবহারকারীর জন্য আরও সহজ ও সহজলভ্য অভিজ্ঞতা দেওয়ার উদ্দেশ্যে তৈরি করা হয়েছে। এই ফাইলগুলোর গঠন জেনোটাইপিং প্ল্যাটফর্ম দ্বারা তৈরি raw data-এর মতো, এবং এগুলো এমনভাবে প্রস্তুত করা হয়েছে যাতে অ-বিশেষজ্ঞ ব্যবহারকারীরাও আরও সহজে তাঁদের জেনেটিক ডেটা অন্বেষণ করতে পারেন। এছাড়াও, তৃতীয় পক্ষের জেনেটিক বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মে সম্ভাব্য ব্যবহারের সুবিধার্থে এগুলো প্রস্তুত করা হয়েছে।

• TMG MyVariants: এটি এমন একটি ফাইল যার ফর্ম্যাট এবং বিষয়বস্তু বাহ্যিক জেনেটিক বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মগুলির সাথে সামঞ্জস্যতা বাড়ানোর জন্য অভিযোজিত হয়েছে। এর লক্ষ্য হল ব্যবহারকারীকে একটি সহজ, কাঠামোগত ফাইল সরবরাহ করা, যা জেনোটাইপিংয়ের কাঁচা ডেটার অনুরূপ, এইভাবে WGS এর মাধ্যমে প্রাপ্ত জেনেটিক তথ্যের কিছু অংশ পরীক্ষা করা সহজ করে তোলে। 

• TMG MyVariants Ultra: এতে TMG MyVariants এ অন্তর্ভুক্ত সমস্ত তথ্য রয়েছে এবং অতিরিক্তভাবে সেই বৈচিত্রগুলি অন্তর্ভুক্ত করে যেখানে আপনার জিনোটাইপ রেফারেন্স/রেফারেন্স নয়। এর মানে হল যে এটি সেই অবস্থানগুলিকে আরও বিস্তৃতভাবে পরীক্ষা করার অনুমতি দেয় যেখানে আপনার DNA রেফারেন্স জিনোমের তুলনায় কিছু পার্থক্য উপস্থাপন করে। এই ফাইলটি ব্যবহারকারীকে জটিল জৈব-তথ্য ফাইলগুলির সাথে সরাসরি কাজ করার প্রয়োজন ছাড়াই তাদের জেনেটিক পরিবর্তনশীলতা আরও সহজভাবে অন্বেষণ করতে সক্ষম করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। 

দ্বিতীয়ত, “প্রযুক্তিগত ডাউনলোড” বিভাগে ব্যবহারকারীর জন্য জেনোমিক বিশ্লেষণের ওয়ার্কফ্লোতে প্রচলিত ফরম্যাটে ফাইল সরবরাহ করা হয়। এই ফাইলগুলো উন্নত ব্যবহারকারী, বায়োইনফরমেটিশিয়ান, গবেষক বা পেশাদারদের জন্য তৈরি, যারা আরও নির্দিষ্ট প্রযুক্তিগত বিশ্লেষণ করতে চান।

• FASTQ ফাইল: এটি সিকোয়েন্সিং মেশিনের কাঁচা আউটপুট ফাইল। এতে প্রক্রিয়াবিহীন DNA রিড থাকে, সাথে প্রতিটি রিডের নির্ভরযোগ্যতা নির্দেশ করে এমন মানের স্কোর থাকে। এটি সবচেয়ে সম্পূর্ণ ফর্ম্যাটগুলির মধ্যে একটি, কারণ এটি সিকোয়েন্সিংয়ের সময় তৈরি প্রাথমিক তথ্য সংরক্ষণ করে। তবে, এটি একটি বড় ফাইল এবং এর ব্যবহারের জন্য বায়োইনফরম্যাটিক জ্ঞান, সেইসাথে এর প্রক্রিয়াকরণের জন্য নির্দিষ্ট সরঞ্জাম প্রয়োজন। 

• VCF ফাইল (Variant Call Format): এটি একটি রেফারেন্স জিনোমের সাথে সারিবদ্ধকরণ এবং তুলনা করার পরে সিকোয়েন্সিং ডেটার বায়োইনফরমেটিক প্রক্রিয়াকরণের ফলাফল (GRCh37)। এতে ব্যবহারকারীর DNA-তে চিহ্নিত ভেরিয়েন্টগুলি সম্পর্কে তথ্য থাকে, অর্থাৎ, সেই অবস্থানগুলি যেখানে রেফারেন্স জিনোমের সাথে একটি পার্থক্য সনাক্ত করা হয়েছে। এই ফর্ম্যাটটি জিনোমিক ভেরিয়েন্টগুলির বিশ্লেষণ, ফিল্টারিং এবং ব্যাখ্যার জন্য জেনেটিক্স এবং বায়োইনফরম্যাটিক্সে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়। 

• CRAM ফাইল: এটি একটি সংকুচিত বাইনারি ফর্ম্যাট যা একটি রেফারেন্স জিনোমের বিরুদ্ধে সারিবদ্ধ জিনোমিক সিকোয়েন্সিং ডেটা সংরক্ষণ করতে ব্যবহৃত হয় (GRCh37)। এতে সিকোয়েন্সিংয়ের পরে প্রাপ্ত DNA রিডগুলির তথ্য থাকে, যা রেফারেন্স জিনোমের কোন অবস্থানে তারা সারিবদ্ধ হয় তা নির্দেশ করে, সাথে মানের ডেটা এবং অন্যান্য প্রযুক্তিগত মেটাডেটা থাকে। এর সঠিক ব্যাখ্যার জন্য নির্দিষ্ট বায়োইনফরমেটিক সরঞ্জাম এবং অনেক ক্ষেত্রে, সারিবদ্ধকরণের সময় ব্যবহৃত রেফারেন্স জিনোম প্রয়োজন। FASTQ এর মতো, এটি একটি প্রযুক্তিগত এবং বড় ফাইল, তাই এটি মূলত উন্নত ব্যবহারকারী, বায়োইনফরম্যাটিক্স বিশেষজ্ঞ বা গবেষকদের জন্য উদ্দিষ্ট।