Да, это обычная ситуация. Для оценки предрасположенности мы учитываем исследованные варианты, включённые в модель данного заболевания. У каждого свой вес: одни повышают предрасположенность, другие снижают.
Результат зависит от того, чьё влияние преобладает. Например, несколько вариантов риска с сильным эффектом могут давать высокую предрасположенность даже при наличии большого числа защитных вариантов.