Что такое файлы Raw Data и что они содержат?

Обновлено

Файлы Raw Data содержат ваши необработанные генетические данные в том виде, в котором они получены из лаборатории, без интерпретации. Эти данные принадлежат вам, и вы можете скачать их в своём аккаунте (для Ultra — на условиях tellmeGen+). 

Starter и Advanced. Файл .csv с маркерами, определяемыми чипом для генотипирования, и вашим генотипом для каждого из них: 

  • rsID: идентификатор варианта, обычно его код «rs» в общедоступной базе dbSNP; для некоторых маркеров чипа используются собственные идентификаторы. 
  • Хромосома: от 1 до 22, X, Y или MT (митохондриальная). 
  • Позиция: координата в референсном геноме GRCh37. 
  • Генотип: две буквы, соответствующие вашему генотипу в этой позиции (A, T, G, C), либо I и D для вставок и делеций. 

Этот файл не прошёл контроль качества, который мы проводим перед интерпретацией данных. 

Ultra. Вы можете скачать данные в четырёх форматах (CRAM, CSV, FASTQ и VCF), доступных в двух разделах аккаунта: 

  • Файлы для скачивания: MyVariants и MyVariants Ultra в формате .csv, предназначенные для просмотра без знаний биоинформатики. 
  • Технические файлы: CRAM, FASTQ и VCF — стандартные биоинформатические форматы для опытных пользователей. 

Эти данные носят информационный характер и не должны использоваться для постановки диагноза.