Файл CRAM содержит прочтения вашей ДНК, уже выровненные относительно референсного генома GRCh37: он указывает положение каждого фрагмента в геноме и содержит данные о качестве. Это следующий этап обработки после FASTQ, сохранённый в сжатом формате, который занимает значительно меньше места.
Его используют для изучения отдельных участков генома, анализа покрытия, поиска вариантов и проверки находок. Для чтения нужны биоинформатические инструменты, например samtools, bcftools или IGV, и референсный геном GRCh37 — тот же, который применялся при выравнивании и необходим для распаковки. Ориентировочные требования: Linux или macOS (в Windows — через WSL или другие совместимые инструменты), не менее 32 ГБ оперативной памяти и достаточно места на диске.