FASTQ ফাইলটি হল হোল জিনোম আল্ট্রা সিকোয়েন্সিং (WGS) এ ব্যবহৃত সিকোয়েন্সিং মেশিন থেকে কাঁচা আউটপুট ফাইল, যা আপনার DNA এর ১০০% ডিকোড করে। এই ফাইলটিতে সমস্ত অপ্রক্রিয়াজাত জেনেটিক ডেটা রয়েছে - অর্থাৎ, DNA লক্ষ লক্ষ অক্ষরের স্ট্রিং (A, C, G, T) আকারে পঠিত হয় - সেই সাথে মানের স্কোর যা পঠনের নির্ভরযোগ্যতা নির্দেশ করে।
FASTQ জৈব তথ্যবিদ এবং গবেষকরা ব্যবহার করেন যারা তাদের ডিএনএর বিশদ বিশ্লেষণ করতে চান, যেমন অ্যালাইনমেন্ট এবং বৈকল্পিক সনাক্তকরণ শুরু থেকেই। এটি এমন ব্যবহারকারীদের জন্যও কার্যকর যারা ভবিষ্যতে বিশ্লেষণের জন্য তাদের কাঁচা ডেটা সংরক্ষণ করতে চান, উদাহরণস্বরূপ, যদি নতুন রেফারেন্স জিনোম প্রকাশিত হয়।
FASTQ ফাইলের বৈশিষ্ট্য :
- সম্পূর্ণতা : কোনও তথ্য ফিল্টার না করেই সিকোয়েন্সার দ্বারা উত্পাদিত প্রতিটি পঠন ধারণ করে।
- পক্ষপাতহীন : নির্দিষ্ট বৈজ্ঞানিক সীমাবদ্ধতা বা রেফারেন্স জিনোম দ্বারা প্রভাবিত নয়।
সীমাবদ্ধতা :
- মানুষের পঠনযোগ্য নয় : আপনার জিনগত বৈশিষ্ট্য সম্পর্কে তথ্য পেতে আপনি সরাসরি একটি FASTQ ফাইল "পড়তে" পারবেন না। দরকারী তথ্য বের করার জন্য এটি প্রক্রিয়াজাত করতে হবে।
- স্টোরেজ সাইজ : FASTQ ফাইলের আকার বড় হওয়ার কারণে, হার্ড ড্রাইভে উল্লেখযোগ্য জায়গার প্রয়োজন হয়।
ফর্ম্যাট এবং ডাউনলোড :
FASTQ ছাড়াও, আমরা VCF ফর্ম্যাটও অফার করি। আপনি tellmeGen- এ আপনার ব্যবহারকারী অ্যাকাউন্ট থেকে সরাসরি এই ফাইলগুলি ডাউনলোড করতে পারেন।
প্রযুক্তিগত প্রয়োজনীয়তা :
- অপারেটিং সিস্টেম : লিনাক্স অথবা ম্যাকওএস (কমান্ড লাইন দক্ষতা প্রয়োজন)।
- RAM : সর্বনিম্ন ১৬ জিবি (বিশ্লেষণের জন্য ৩২ জিবি বা তার বেশি সুপারিশ করা হয়)।
- স্টোরেজ : > ২০০ জিবি।
এই ফর্ম্যাটটি উন্নত ব্যবহারকারীদের জন্য উপযুক্ত যারা তাদের জেনেটিক ডেটার আরও বিশদ এবং সুনির্দিষ্ট বিশ্লেষণ করতে চান।