FASTQ ফাইল কী?

আপডেট করা হয়েছে

FASTQ ফাইল সিকোয়েন্সার থেকে পাওয়া সরাসরি ডেটা। এতে আপনার DNA-র সব রিড থাকে—A, C, G ও T অক্ষরের কয়েকশো মিলিয়ন ছোট অক্ষরক্রম, প্রতিটি অক্ষরের জন্য একটি গুণমান স্কোরসহ। 

এটি সবচেয়ে পূর্ণাঙ্গ ফরম্যাট, কারণ এটি কোনো রেফারেন্স জিনোমের ওপর নির্ভর করে না। এই ডেটা থেকে আরও নতুন বা ভবিষ্যতে প্রকাশিত রেফারেন্স ব্যবহার করে পুনরায় বিশ্লেষণ করা যায়। বায়োইনফরমেটিক্স বিশেষজ্ঞ ও গবেষকেরা DNA রিড অ্যালাইন করতে এবং শুরু থেকে ভ্যারিয়েন্ট শনাক্ত করতে এটি ব্যবহার করেন। 

ফাইলটি সরাসরি পড়ে আপনার বৈশিষ্ট্য বা জেনেটিক প্রবণতা জানা যায় না। বিশেষ সফটওয়্যার দিয়ে প্রক্রিয়াকরণ করতে হয়। আনুমানিক প্রয়োজন: Linux বা macOS, কমান্ড লাইনের ব্যবহারজ্ঞান, অন্তত 16 GB RAM (32 GB সুপারিশকৃত) এবং 200 GB-এর বেশি স্টোরেজ।