फ़ाइलें MyVariants और MyVariants Ultra CSV प्रारूप की फ़ाइलें हैं, जो संपूर्ण जीनोम सीक्वेंसिंग (WGS) डेटा से जनरेट की जाती हैं, जो आपके DNA के 100% का विश्लेषण करती है। इन फ़ाइलों को उपयोगकर्ता की आनुवंशिक जानकारी के एक हिस्से तक अधिक सरल, संरचित और genotyping array विश्लेषणों में उपयोग की जाने वाली raw data फ़ाइलों के समान प्रारूप में पहुँच को आसान बनाने के लिए बनाया गया है।
दोनों फ़ाइलों में कॉलम में व्यवस्थित आनुवंशिक जानकारी होती है, जिसमें variant identifiers (rsID), genomic positions (GRCh37) और उपयोगकर्ता के genotypes शामिल हैं। इनका उद्देश्य इस जानकारी को देखने का एक अधिक सुलभ तरीका प्रदान करना है, बिना अधिक जटिल तकनीकी फ़ाइलों जैसे FASTQ, CRAM या VCF के साथ सीधे काम करने की आवश्यकता के।
फ़ाइल MyVariants मुख्य रूप से Ultra DNA test के उन उपयोगकर्ताओं के लिए बनाई गई है जो अपने आनुवंशिक डेटा का उपयोग ऐसी अन्य platforms पर करना चाहते हैं जो raw data-type फ़ाइलों के साथ compatible हों। इसकी संरचना कुछ external tools के लिए आनुवंशिक जानकारी को पहचानना और process करना आसान बनाती है, ठीक वैसे ही जैसे वे genotyping array से प्राप्त data के साथ करते हैं।
दूसरी ओर, MyVariants Ultra फ़ाइल जानकारी का एक अधिक विस्तृत version शामिल करती है। MyVariants में शामिल data के अलावा, इसमें उन variants के genotypes भी शामिल होते हैं जिनमें उपयोगकर्ता reference/reference genotype प्रस्तुत नहीं करता। इससे उन positions को अधिक detail में explore करना संभव होता है जहाँ उपयोगकर्ता का genome reference genome से भिन्न होता है।
MyVariants फ़ाइल की विशेषताएँ:
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सरल प्रारूप: यह CSV प्रारूप में प्रदान की जाती है, जो Excel, Google Sheets या basic bioinformatics tools जैसे programs के साथ compatible है।
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Array raw data जैसी संरचना: यह आनुवंशिक जानकारी को ऐसे format में प्रस्तुत करती है जो उन users के लिए परिचित है जिन्होंने पहले genotyping files के साथ काम किया है।
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External platforms पर उपयोग: इसे ऐसी third-party platforms पर data upload करना आसान बनाने के लिए design किया गया है जो structured genetic files स्वीकार करती हैं।
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सुलभता: यह कुछ genotypes को complex technical formats की तुलना में अधिक आसानी से देखने की अनुमति देती है।
MyVariants Ultra फ़ाइल की विशेषताएँ:
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अधिक विवरण स्तर: इसमें WGS analysis से प्राप्त variants का अधिक विस्तृत selection शामिल है।
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Non-reference/reference variants: इसमें उन variants के genotypes शामिल होते हैं जिनमें user reference genome की तुलना में अंतर प्रस्तुत करता है।
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उन्नत लेकिन सुलभ exploration: यह उन users के लिए बनाई गई है जो अपनी genetic information को अधिक depth में review करना चाहते हैं, लेकिन सीधे VCF, CRAM या FASTQ files को handle करने की आवश्यकता के बिना।
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CSV प्रारूप: इसे सामान्य spreadsheet tools के साथ खोला जा सकता है, जिससे specific variants को search, filter और review करना आसान होता है।
सीमाएँ:
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यह interpreted report के बराबर नहीं है: MyVariants और MyVariants Ultra files में genetic data होता है, लेकिन वे अपने आप medical, clinical या diagnostic interpretation प्रदान नहीं करतीं।
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VCF का विकल्प नहीं है: हालांकि ये files variants को consult करना आसान बनाती हैं, VCF file genomic variants की bioinformatics analysis के लिए अभी भी सबसे पूर्ण और standardized technical format है।
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Variable compatibility: कुछ external platforms सभी formats स्वीकार नहीं कर सकतीं या file की specific adaptations की आवश्यकता हो सकती है।
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Interpretation में सावधानी आवश्यक है: किसी specific genotype की उपस्थिति का अर्थ आवश्यक रूप से कोई medical condition, predisposition या specific trait नहीं होता। Interpretation हमेशा उचित context में की जानी चाहिए और health-related information के मामले में qualified professionals द्वारा की जानी चाहिए।
Formats और download:
उन users के लिए जिन्होंने WGS 30x test कराया है, MyVariants और MyVariants Ultra files के अलावा, हम FASTQ, CRAM और VCF जैसे अन्य formats भी प्रदान करते हैं। आप इन files को सीधे अपने tellmeGen user account से download कर सकते हैं।
