Alahaplogruupit eli alaliinat ovat haplogruupin sisällä olevia pienempiä haaroja. Ne määritellään harvinaisempien ja spesifisempien lisämuunnosten perusteella, joiden avulla sukujuuriasi voidaan luokitella tarkemmin.
Tuloksissasi näet äitipuolellisen haplogruupisi ja alahaplogruupisi sekä, jos olet mies, myös isäpuolelliset.