Jak mogę pobrać surowe dane dotyczące genotypowania i jakie platformy umożliwiają ich analizę?

Zaktualizowano dnia

Ważne: surowe dane genotypowania znajdują się tylko w zestawach Starter i Advanced firmy tellmeGen.

Aby pobrać plik surowe dane dotyczące genotypowania albo Surowe dane z powiedz miGen, wpisz swoje Teren prywatny i przejdź do menu użytkownika w sekcji UstawieniaZestawyPOBIERZ SUROWE DANE, na końcu sekcji Zestawy, gdzie znajdziesz łącze.

Kiedy klikniesz Pobierz surowe dane, plik zostanie wygenerowany w formacie .csv który obejmuje ponad 750 000 zakładek chipu genotypującego wraz z jego genotyp odpowiedni. Ten plik zawiera:

  • Pozycja na chromosomie gdzie znajduje się każdy znacznik (rsID).
  • Twój genotyp dla każdego markera, składającego się z dwóch alleli.

Ten plik Surowe dane może być użyty do zapytania o Twój genotyp pod kątem dowolnego znacznika lub bycia przesłane na inne platformy które akceptują surowe pliki danych. Niektóre popularne platformy do analizy surowych danych powiedz miGen włączać Prometeza, Moje prawdziwe pochodzenie, I Nutrahaker.

Aby używać pliku na tych platformach, po prostu rozpakuj plik .zamek błyskawiczny pobrany i otrzymasz plik .csv gotowy do przesłania na wspomniane platformy.

Należy pamiętać, że niektóre platformy, takie jak Moje dziedzictwo albo Łącze genomu, nie akceptuj obecnie surowych danych z powiedz miGen ze względu na umowy o współpracy z podmiotami trzecimi. Jednakże, powiedz miGen Nadal pracujemy nad rozszerzeniem obsługi na więcej platform, a użytkownicy zostaną powiadomieni, gdy to nastąpi.