La genotipizzazione legge posizioni specifiche del DNA, scelte perché variano tra le persone: molte sono associate a tratti o condizioni, mentre altre permettono di stimare, tramite imputazione, le varianti vicine. Il sequenziamento legge il DNA lettera per lettera, nell'ordine esatto in cui si presenta, e nel caso di Ultra copre praticamente tutto il genoma.
La genotipizzazione è molto precisa per le varianti comuni e ha un costo inferiore; per questo la utilizziamo in Starter e Advanced. Il sequenziamento rileva anche varianti rare o non presenti su alcun chip e genera dati riutilizzabili in analisi future: è la tecnologia di Ultra.