इम्प्यूटेशन

यह सांख्यिकीय विधि चिप द्वारा सीधे पढ़े गए वेरिएंट की संदर्भ जीनोम से तुलना करके उन वेरिएंट का अनुमान लगाती है जिन्हें चिप सीधे नहीं पढ़ती। आम वेरिएंट के लिए यह बहुत सटीक है, लेकिन दुर्लभ वेरिएंट के लिए इसकी सटीकता कम है।