Cílem farmakogenetiky je snížit nežádoucí reakce na léky. U některých léčiv existují přesvědčivé vědecké důkazy, že farmakogenetická doporučení pomáhají těmto reakcím předcházet.
Přesto mají vliv i další faktory: neanalyzované varianty, jiná onemocnění, další léky nebo životní styl. Před jakýmkoli rozhodnutím proto vždy posuďte výsledky s lékařem.
Před užíváním většiny léků dnes farmakogenetický test není povinný. Organizace jako FDA, CPIC a DPWG vydávají doporučení k jeho použití, která se však liší podle léčiva a dostupných důkazů.