Co jsou soubory Raw Data a co obsahují?

Actualizado en

Soubory Raw Data obsahují vaše nezpracované genetické údaje v podobě, v jaké je získáme z laboratoře, bez interpretace. Patří vám a můžete si je stáhnout ze svého účtu. U testu Ultra platí podmínky tellmeGen+. 

Starter a Advanced. Soubor .csv obsahuje markery genotypizačního čipu a váš genotyp u každého z nich: 

  • rsID: identifikátor varianty, obvykle kód „rs“ z veřejné databáze dbSNP. Některé markery čipu mají vlastní identifikátory. 
  • Chromozom: 1 až 22, X, Y nebo MT (mitochondriální). 
  • Pozice: podle referenčního genomu GRCh37. 
  • Genotyp: dvě písmena, která máte na dané pozici (A, T, G, C), případně I a D pro inzerce a delece. 

Tento soubor neprošel kontrolami kvality, které provádíme před interpretací údajů. 

Ultra. Údaje si můžete stáhnout ve čtyřech formátech (CRAM, CSV, FASTQ a VCF), rozdělených do dvou sekcí vašeho účtu: 

  • Ke stažení: MyVariants a MyVariants Ultra ve formátu .csv, určené k prohlížení bez znalostí bioinformatiky. 
  • Technické soubory ke stažení: CRAM, FASTQ a VCF, standardní bioinformatické formáty pro pokročilé uživatele. 

Tyto údaje mají informativní charakter a nemají se používat ke stanovení diagnózy.