Ikäarvio kertoo, milloin haplogruppiasi määrittelevän variantin kantanut esi-isäsi eli. Se lasketaan ”molekyylisikikellon” avulla: lasketaan tämän jälkeen kyseiseen haplogruppiin syntyneiden linjojen varioiden määrä ja verrataan sitä uusia variantteja syntyvään keskimääräiseen nopeuteen, joka on kalibroitu muinaisen DNA:n ja tunnettujen sukupuun perusteella. Siksi kyseessä on arvio, jonka virhemarginaali on usein tuhansia vuosia. Kaikki tämän jälkeen kyseisessä linjassasi eläneet esi-isäsi kuuluvat haplogruppiisi; myöhemmin syntyneet variantit määrittelevät alahaplogruppiasi.
