ジェノタイピングは、人によって異なるDNAの特定の位置を読み取ります。形質や疾患・状態に関連する位置のほか、インピュテーションで周辺のバリアントを推定するための位置も含まれます。シーケンスはDNAを実際の順番どおり1文字ずつ読み取り、Ultraではほぼ全ゲノムを対象にします。
ジェノタイピングは一般的なバリアントに対して精度が高く、費用も抑えられるため、StarterとAdvancedに使用しています。シーケンスは希少なバリアントやチップに含まれないバリアントも検出でき、将来の解析に再利用できるデータが得られます。Ultraはこの技術を使用します。